# HackMD Üzerinde Sunum Hazırlama > [name= Hüseyin Ali ŞAŞIRMAZ - 2000003006] > [date: Dec 22th, 2023] --- ## GİRİŞ **Hazırlayan:** Hüseyin Ali ŞAŞIRMAZ **Numara:** 2000003006 Bu ödev [İKÜ Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü](https://mobigen.iku.edu.tr/en) [MBG7003-2023 Biyoinformatik dersi](https://akademikpaket.iku.edu.tr/TR/ects_bolum.php?m=1&p=4&f=1&r=0&ders_id=154&ects=ders_detay&yariyil=7) içindir.  [Resim Kaynağı](https://mobigen.iku.edu.tr/en) --- ## Gene Expression Analizleri Nelerdir? EST, UniGene ve Mikroarray --- ## EST (Expressed Sequence Tag) 1. Kısa diziler (100-700 bp). 2. Alınan örnekte ifade edilen genlerin veya gen ifadesi profilinin ortaya çıkarılması için kullanılır. 3. [EST ler sadece fonksiyonu bilinen proteinlerin dizi bilgilerini ifade eder. Buveriler kullanılarak da model olmayan bir organizmanın kısmi genomu oluşturulabilir yani bu kısımlarla genom bilgisinin genel durumu yorumlanabilir.](https://avesis.istanbul.edu.tr/resume/downloadfile/nermin?key=dcbb3e80-c0e7-4c6f-a686-c3606292bc0e) ---  [Resim Kaynağı](https://slideplayer.com/slide/9089748/) --- ## EST VERİTABANLARI TABLOSU |EST VERİTABANLARI|GÖREVLERİ| |------------|---------| |Blast (dbEST)| Genbank'a bulunan EST dizilerinden oluşturulmuş indeks.| |UniGene| EST'lerin gen odaklı kümelenmesiyle non-redundant oluşturulmuştur. --- ## UniGene 1.[EST'leri ve diğer mRNA dizilerini, genomik DNA üzerinde açıklamalı kodlama dizileri (CDS'ler) ile birlikte ilgili dizilerin alt kümeleri halinde kümeler. Çoğu durumda, her küme, alternatif olarak birleştirilmiş transkriptler de dahil olmak üzere, tek bir gen tarafından üretilen dizilerden oluşur.](https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1874533405800048/) ---  [Resim Kaynağı](https://http://www.unigene.eu/) --- ## Mikroarray Analizi 1. [Hücre ve dokulardaki gen ekspresyonlarının topluca incelenmesine olanak sağlayan yeni vegüçlü bir teknolojidir. Transkripsiyonun genomik birölçekte değerlendirilmesi, bir mozaik şeklinde tümgenomu barındıran DNA mikroarray teknolojisi ile sağlanabilmiştir.](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11208413/) --- **Mikroarray İşlem Basamakları. **  [Resim Kaynağı](https://dergipark.org.tr/tr/download/article-file/421103) --- ## Mikroarray İşlem Basamakları - [1] Mikroarray' in hazırlanması. - [2] Test edilecek örneklerin hazırlanıp etiketlenmesi. - [3] Hibridizasyon. - [4] Yıkama. - [5] Etiketlerin uyarılması. - [6] Görüntü tarama / Veri işleme - analizi. [Kaynak](https://dergipark.org.tr/tr/download/article-file/421103) --- **Mikroarry Yapılışının Şematik Gösterimi.**  [Resim Kaynağı](https://fullsepp.com/?contentid=835_1200000000000_4870) ---  [Resim Kaynağı](https://www.pngwing.com/tr/free-png-bbhyt)