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Guia para baixar sequências do Genbank
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## Conteúdo

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## Baixar sequências no Genbank

1. Acesse o site https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/
2. Clique em **"Sign in to NCBI"** (canto superior direito)
3. Caso já possua uma conta, faça o login. Caso contrário, crie uma conta.
4. No canto superior esquerdo, escolha o tipo de dado que deseja procurar. Se seu objetivo é trabalhar com nucleotídeos, selecione essa opção. Em seguida preencha o táxon, podendo adicionar também a região que deseja buscar, e clique em **"search"**


5. Assim que a busca for concluída será exibida um tela como a apresentada abaixo:


6. Nessa tela há três colunas com dados: a primeira coluna permite filtrar os dados por categorias (planta, animais, microorganismos; compartimento genético da sequência; tipo de sequência; etc); a última coluna mostra um relatório dos resultados (*Results by taxon*) indicando quais espécies correspondentes ao gênero buscado foram encontradas e, entre parênteses, o número de sequência para cada espécie. *(Ps.: confirme que todas as espécies mostradas realmente pertencem ao gênero buscado!)* Por fim, na porção mediana da tela são exibidos os resultados encontrados.

8. Selecione as sequências desejadas. Clique em **"Sent to"** no canto superior direito. Nessa opção é possível clicar em **"File"** caso queira baixar as sequências diretamente, mas vamos inicialmente guardar as sequências uma pasta na sua conta até finalizar as buscas pelos demais gêneros de interesse. Clique em **"Collections"** e guarde as sequências uma pasta na sua conta.


Guardar sequências
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1. Com a sequência selecionada, clique em **"sent to"**, depois em **"collections"** e confirme em **"Add"**.

2. Uma nova janela vai abrir perguntando o que você deseja fazer. Selecione a opção **"Create new collection"**. Dê um nome para a coleção (dê um nome diferente para cada projeto seu!) e clique em **"Save"**.


3. A qualquer momento ao longo do desenvolvimento do estudo, novas sequências poderão ser adicionadas na mesma pasta: basta selecioná-las nas busca, clicar em **"Sent to" > "Collections" > "Add"** e depois na nova tela que abrir clicar em **"Append to an existing collection"** e selecionar a pasta desejada.

4. Ao finalizar as buscas, acesse a sua pasta: clique em **"My NCBI"** no canto superior direito. As coleções estarão na coluna da direita, segunda caixa, em **Collections**.


Download de sequências em FASTA
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1. Acesse a sua pasta com as sequências selecionadas. Clique em **"Send to"**, selecione **"File"** e depois selecione o **formato FASTA** e depois clique em **"Create file"**. O arquivo será baixado.


*Obs1:* É possível mudar a ordem das sequências clicando em "Sort by".

###### tags: `Sistemática Filogenética`, `PPG Evolução e Diversidade`